SWISS ROWING ist als nationaler Fachverband des Rudersports in der Schweiz mit einer klaren Trennung zwischen strategischer Führung und operativer Umsetzung organisiert. 

Oberstes Organ des Verbandes ist die  Delegiertenversammlung, welche die Mitgliedsvereine vertritt und unter anderem über Statuten, Wahlen, Jahresrechnung sowie die strategische Ausrichtung des Verbandes entscheidet. Sie wählt den Vorstand, der für die strategische Führung des Verbandes sowie dessen Vertretung nach aussen verantwortlich ist. Zu seinen Aufgaben gehören insbesondere die Festlegung der Verbandsstrategie und -ziele, der Erlass von Reglementen, die Aufsicht über die operative Führung sowie die Einsetzung von Kommissionen oder Arbeitsgruppen für spezifische Aufgaben.

Die operative Leitung obliegt dem Verbandsdirektor, der den Schweizerischen Ruderverband gemeinsam mit den Mitarbeitenden der Geschäftsstelle führt. Die Geschäftsstelle ist insbesondere für die Umsetzung der Verbandsstrategie und das Tagesgeschäft in den Bereichen Leistungsrudern, Regattawesen, Ausbildung und Breitensport verantwortlich. Ihr Sitz befindet sich im «Haus des Schweizer Rudersports» in Sarnen (Kanton Obwalden).

Ergänzt wird die Verbandsorganisation durch die Rechnungsrevisoren, welche die Finanzführung prüfen, sowie das Schiedsgericht als unabhängige Instanz zur Beurteilung von Streitfällen innerhalb des Verbandes.